2018年4月-10月，經過提出申請、學位分委員會審核、外部專家評議、醫學部學位會審核，社會公示等流程，2018年10月30日，北京大學學位評定委員會第137次會議通過了北京大學健康醫療大數據國家研究院在“醫學技術”一級學科下設立“健康數據科學”二級學科的申請。該學科的設立對健全我校學科設置，培養健康醫療大數據應用與分析領域人才具有重要意義。
健康數據科學主要以健康醫療領域大數據為驅動，以數據科學方法為工具，關注健康醫療領域大數據的挖掘及研究成果的轉化。健康數據科學需要有數學、計算機科學、統計學等基礎理論的支撐，同時要對醫學領域背景知識有深刻的理解。
北京大學作為我國首個開設“健康數據科學”專業的院校，開設該專業將有助于擴大我國在健康數據挖掘領域的人才隊伍，健全交叉學科設置?！敖】禂祿茖W”專業將于2020年開始首屆研究生的培養工作。
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