【項(xiàng)目內(nèi)容】
文獻(xiàn)數(shù)據(jù)是醫(yī)學(xué)知識的顯性載體，互聯(lián)網(wǎng)上日益豐富的文獻(xiàn)是不可多得的優(yōu)質(zhì)資源與科研寶藏。從海量醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)和信息中精準(zhǔn)抽取醫(yī)學(xué)知識不僅是保持知識更新、提高研究效率的有效路徑，更是孕育大量醫(yī)學(xué)科研創(chuàng)新成果的“藍(lán)海”。
本課程聚焦醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)大數(shù)據(jù)中的知識挖掘，基于常見疾病場景及經(jīng)典案例進(jìn)行課程設(shè)計(jì)，強(qiáng)調(diào)數(shù)據(jù)分析賦能科研產(chǎn)出，突出創(chuàng)新性與實(shí)用性，旨在培訓(xùn)學(xué)員：
學(xué)習(xí)海量文獻(xiàn)及其關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)的獲取和分析方法；
了解國際最新研究熱點(diǎn)；
了解醫(yī)學(xué)知識庫賦能數(shù)據(jù)挖掘的途徑與案例；
熟悉從知識網(wǎng)絡(luò)擾動(dòng)和演化的角度發(fā)掘重要發(fā)現(xiàn)；
掌握重大疾病復(fù)雜病因網(wǎng)絡(luò)挖掘和因果建模工具；
啟發(fā)創(chuàng)新科研思路，加強(qiáng)基于公開數(shù)據(jù)資源開展醫(yī)學(xué)研究的科研素養(yǎng)，提高論文撰寫效率；
全面提升從醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)中發(fā)現(xiàn)科學(xué)問題，從數(shù)據(jù)研究中提煉知識與證據(jù)，運(yùn)用研究成果提升臨床實(shí)踐的全周期各項(xiàng)關(guān)鍵能力
【辦學(xué)單位】
北京大學(xué)醫(yī)學(xué)繼續(xù)教育學(xué)院
【學(xué)術(shù)支持單位】
北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國家研究院
【招生對象】
本次工作坊的教學(xué)案例主要根據(jù)常見疾病場景設(shè)計(jì)，適合希望通過學(xué)習(xí)，全面提升應(yīng)用公開數(shù)據(jù)資源開展醫(yī)學(xué)研究能力的臨床工作者，及健康數(shù)據(jù)科學(xué)相關(guān)從業(yè)者等。包括但不限于：
有需要沒思路，面對海量文獻(xiàn)數(shù)據(jù)無從下手的研究新人；
有想法缺證據(jù)，希望通過文獻(xiàn)數(shù)據(jù)挖掘醫(yī)學(xué)知識、支撐課題設(shè)計(jì)和臨床決策的科研骨干；
有基礎(chǔ)待提升，希望基于海量文獻(xiàn)數(shù)據(jù)分析，產(chǎn)出高質(zhì)量創(chuàng)新科研成果的臨床科研人員；
對醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)資源感興趣，希望通過文獻(xiàn)分析快速精準(zhǔn)定位業(yè)內(nèi)關(guān)鍵成果，高效追蹤行業(yè)進(jìn)展和熱點(diǎn)的專業(yè)人員。
【培訓(xùn)地點(diǎn)】
線上直播授課（騰訊會(huì)議網(wǎng)絡(luò)平臺授課）。
【培訓(xùn)時(shí)間】
2023年10月25日-11月5日。
平日晚18:30-21:00，周末上午8:30-12:00，下午13:30-18:00，共計(jì)30學(xué)時(shí)。
見具體課程安排。
【課程安排】
時(shí)間 |
主題 |
案例分析/操作練習(xí) |
10月25日（周三）
18:30-21:00 |
18:30-19:00 專家講座：張路霞 北京大學(xué) |
醫(yī)學(xué)知識圖譜應(yīng)用——數(shù)據(jù)科學(xué)家（知識發(fā)現(xiàn)）與實(shí)驗(yàn)科學(xué)家（科學(xué)發(fā)現(xiàn)）的互動(dòng) |
從臨床醫(yī)師到醫(yī)師科學(xué)家-大數(shù)據(jù)時(shí)代的新契機(jī) |
19:00-21:00發(fā)揮文獻(xiàn)價(jià)值：海量文獻(xiàn)自動(dòng)處理與知識挖掘 |
l 鏈接思維：以PubMed為中心的數(shù)據(jù)庫之間知識鏈接 |
l 快速上手：知識挖掘簡易工具 |
10月27日（周五）
18:30-21:00 |
18:30-20:00善用公開資源：高質(zhì)量公開知識庫的探知與復(fù)用 |
慢性病治療方案的大規(guī)模跨國研究 |
l 賦能醫(yī)療大數(shù)據(jù)分析的公共知識庫 |
l 不同體系之間的術(shù)語映射及其標(biāo)準(zhǔn)化 |
l 醫(yī)學(xué)知識體系應(yīng)用進(jìn)展 |
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20:00-21:00 專家講座：袁馳 河海大學(xué)計(jì)算機(jī)學(xué)院
臨床試驗(yàn)納排標(biāo)準(zhǔn)中的知識抽取與二次利用 |
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10月29日（周日）
8:30-12:00 |
8:30-9:30 專家講座：Bei Yu 美國雪城大學(xué)
科學(xué)出版物與新聞中因果關(guān)系主張、健康建議及夸張表述的自然語言理解 |
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9:30-12:30梳理研究綜述：如何快速鎖定流行病學(xué)數(shù)據(jù)與關(guān)鍵文獻(xiàn)？ |
疾病負(fù)擔(dān)分布與醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)關(guān)聯(lián)分析——以腦卒中研究為例 |
l 疾病負(fù)擔(dān)數(shù)據(jù)獲取 |
l 關(guān)鍵文獻(xiàn)識別 |
l 科學(xué)主張可靠性評估 |
10月29日（周日）
13:30-18:00 |
13:30-17:00優(yōu)化研究設(shè)計(jì)：如何結(jié)合醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)與知識圖譜進(jìn)行因果特征選擇？ |
混雜、中介、對撞變量及背后證據(jù)的發(fā)現(xiàn)——以抑郁作為阿爾茲海默癥的危險(xiǎn)因素 |
l 知識圖譜及三元組數(shù)據(jù)：結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的檢索與獲取 |
l 圖數(shù)據(jù)庫Neo4j的構(gòu)建及查詢 |
l 使用大語言模型進(jìn)行因果關(guān)系抽取 |
17:00-18:00 專家講座：劉婷 荷蘭阿姆斯特丹大學(xué)
利用知識圖譜技術(shù)探索腸道微生物與精神疾病的關(guān)系 |
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11月1日（周三）
18:30-21:00 |
18:30-20:00 專家講座：步一 北京大學(xué)
復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析基礎(chǔ)及其醫(yī)學(xué)應(yīng)用 |
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20:00-21:00 啟發(fā)研究假設(shè)：如何使用開源工具構(gòu)建及分析復(fù)雜疾病的病因網(wǎng)絡(luò)？ |
利用病因網(wǎng)絡(luò)分析方法發(fā)現(xiàn)潛在影響因素——以糖尿病腎病為例 |
l 病因網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建演示與實(shí)操 |
11月3日（周五）
18:30-21:00 |
18:30-20:00 跟蹤研究趨勢：如何基于文獻(xiàn)數(shù)據(jù)揭示特定疾病領(lǐng)域的研究結(jié)構(gòu)？ |
研究領(lǐng)域內(nèi)重要主題解讀和發(fā)展脈絡(luò)繪制——以心腦血管疾病為例 |
l 元數(shù)據(jù)分析（作者、機(jī)構(gòu)、國家、期刊等） |
l MeSH主題詞挖掘（科學(xué)基金、臨床試驗(yàn)與學(xué)術(shù)文獻(xiàn)） |
l 主題聚類分析與工具（VOSviewer, Gephi） |
20:00-21:00 專家講座：吳夢佳 悉尼科技大學(xué)
基于異質(zhì)圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的基因-疾病關(guān)系分類和預(yù)測 |
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11月4日（周六）
8:30-12:00 |
綜合研究證據(jù)：如何通過系統(tǒng)綜述和meta分析匯總分析現(xiàn)有文獻(xiàn)證據(jù)？ |
從不同試驗(yàn)結(jié)果中計(jì)算出綜合效應(yīng)——以新型糖尿病藥物為例 |
l 系統(tǒng)綜述及meta分析：作用及證據(jù)等級 |
l 使用文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行系統(tǒng)綜述 |
l Meta分析方法 |
11月5日（周日）
8:30-12:30 |
線下學(xué)員答疑（問題展示、教師答疑、集體討論、互相啟發(fā)） 線上同步直播互動(dòng)
12：00-12：30 課程回顧與總結(jié) |
【主講教師】
杜 建 北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國家研究院 助理教授等
【培訓(xùn)證書】
學(xué)員完成全部課程學(xué)習(xí)，考評合格，將頒發(fā)北京大學(xué)結(jié)業(yè)證書，加蓋北京大學(xué)鋼印。
【報(bào)名繳費(fèi)】
1. 費(fèi)用：5400 元/人
注：學(xué)員完成全部課程學(xué)習(xí)，考評合格，將頒發(fā)北京大學(xué)結(jié)業(yè)證書，加蓋北京大學(xué)鋼印。
2. 報(bào)名繳費(fèi)流程：
1）報(bào)名：掃描下方二維碼填寫報(bào)名信息。
2）繳費(fèi)：將培訓(xùn)費(fèi)用于截止日期前全額匯入以下賬戶：
賬戶名稱：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部
開戶銀行：工商銀行北京東升路支行
賬 號：0200 0062 0901 4460 440
用途（匯款時(shí)請備注）：健康數(shù)據(jù)科研+學(xué)員姓名
3）確認(rèn)：將繳費(fèi)憑證（轉(zhuǎn)賬截圖/匯款憑證照片）通過微信或郵件發(fā)送給報(bào)名聯(lián)系人崔老師（聯(lián)系方式見下），確認(rèn)報(bào)名成功。
3. 報(bào)名繳費(fèi)截止時(shí)間：2023年10月20日。
注：小班授課，人數(shù)有限，額滿即止（以繳費(fèi)順序?yàn)闇?zhǔn)）。
